MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.08

Total Repeats: 359

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019743	CTAT	2	8	439	446	25 %	50 %	0 %	25 %	428314711
2	NC_019743	CGA	2	6	463	468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314711
3	NC_019743	GAG	2	6	529	534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314711
4	NC_019743	CGC	2	6	551	556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314711
5	NC_019743	AGCC	2	8	575	582	25 %	0 %	25 %	50 %	428314711
6	NC_019743	AAAGGG	2	12	586	597	50 %	0 %	50 %	0 %	428314711
7	NC_019743	TCAC	2	8	825	832	25 %	25 %	0 %	50 %	428314712
8	NC_019743	A	7	7	834	840	100 %	0 %	0 %	0 %	428314712
9	NC_019743	GA	3	6	846	851	50 %	0 %	50 %	0 %	428314712
10	NC_019743	CAT	2	6	874	879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314712
11	NC_019743	TGA	2	6	1368	1373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314713
12	NC_019743	GT	3	6	1374	1379	0 %	50 %	50 %	0 %	428314713
13	NC_019743	GAAAG	2	10	1390	1399	60 %	0 %	40 %	0 %	428314713
14	NC_019743	ATT	2	6	1474	1479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314713
15	NC_019743	GCTT	2	8	1500	1507	0 %	50 %	25 %	25 %	428314713
16	NC_019743	GAG	2	6	1544	1549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314713
17	NC_019743	T	6	6	1567	1572	0 %	100 %	0 %	0 %	428314713
18	NC_019743	GA	3	6	1776	1781	50 %	0 %	50 %	0 %	428314714
19	NC_019743	CGG	3	9	1784	1792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314714
20	NC_019743	TCAA	2	8	1793	1800	50 %	25 %	0 %	25 %	428314714
21	NC_019743	TGGT	2	8	1818	1825	0 %	50 %	50 %	0 %	428314714
22	NC_019743	TTC	2	6	1830	1835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314714
23	NC_019743	TGA	2	6	1869	1874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314714
24	NC_019743	AGG	2	6	1892	1897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314714
25	NC_019743	GAA	2	6	1966	1971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314714
26	NC_019743	AG	3	6	2011	2016	50 %	0 %	50 %	0 %	428314714
27	NC_019743	AAATTG	2	12	2033	2044	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428314714
28	NC_019743	GAA	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314714
29	NC_019743	TGT	2	6	2180	2185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314714
30	NC_019743	ATT	2	6	2268	2273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314714
31	NC_019743	TGA	2	6	2334	2339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314714
32	NC_019743	GAGT	2	8	2355	2362	25 %	25 %	50 %	0 %	428314714
33	NC_019743	TC	4	8	2367	2374	0 %	50 %	0 %	50 %	428314714
34	NC_019743	TGAT	2	8	2610	2617	25 %	50 %	25 %	0 %	428314715
35	NC_019743	ACA	2	6	2619	2624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314715
36	NC_019743	CTCA	2	8	2650	2657	25 %	25 %	0 %	50 %	428314715
37	NC_019743	TA	3	6	2662	2667	50 %	50 %	0 %	0 %	428314715
38	NC_019743	CGC	2	6	2727	2732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314715
39	NC_019743	TGAG	2	8	2767	2774	25 %	25 %	50 %	0 %	428314715
40	NC_019743	CTC	2	6	2816	2821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314715
41	NC_019743	TCA	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314715
42	NC_019743	GAT	2	6	2850	2855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314715
43	NC_019743	CGG	2	6	3081	3086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314715
44	NC_019743	TGACC	2	10	3179	3188	20 %	20 %	20 %	40 %	428314715
45	NC_019743	TGC	2	6	3215	3220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314715
46	NC_019743	AG	3	6	3234	3239	50 %	0 %	50 %	0 %	428314715
47	NC_019743	GGC	2	6	3670	3675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314716
48	NC_019743	ACC	2	6	3688	3693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314716
49	NC_019743	TGG	2	6	3918	3923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314716
50	NC_019743	ACTT	2	8	4135	4142	25 %	50 %	0 %	25 %	428314716
51	NC_019743	ATC	2	6	4230	4235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314717
52	NC_019743	TGG	2	6	4240	4245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314717
53	NC_019743	A	6	6	4461	4466	100 %	0 %	0 %	0 %	428314717
54	NC_019743	GCG	2	6	4495	4500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314717
55	NC_019743	A	6	6	4511	4516	100 %	0 %	0 %	0 %	428314717
56	NC_019743	GTG	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314717
57	NC_019743	GCA	2	6	4676	4681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314717
58	NC_019743	ATCA	2	8	4722	4729	50 %	25 %	0 %	25 %	428314717
59	NC_019743	CAC	2	6	4783	4788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314717
60	NC_019743	GCTGAT	2	12	4851	4862	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428314717
61	NC_019743	ACT	2	6	4935	4940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314717
62	NC_019743	TAA	2	6	5063	5068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314717
63	NC_019743	GTG	2	6	5106	5111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314717
64	NC_019743	ACA	2	6	5191	5196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314717
65	NC_019743	TTG	2	6	5242	5247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314717
66	NC_019743	GCT	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314717
67	NC_019743	CTA	2	6	5374	5379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314717
68	NC_019743	ATTC	2	8	5439	5446	25 %	50 %	0 %	25 %	428314718
69	NC_019743	TCC	2	6	5488	5493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314718
70	NC_019743	CCT	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314718
71	NC_019743	AAC	2	6	5571	5576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314718
72	NC_019743	AGC	2	6	5674	5679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314719
73	NC_019743	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314719
74	NC_019743	GAG	2	6	5706	5711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314719
75	NC_019743	GCG	2	6	5827	5832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314719
76	NC_019743	CAGAGC	3	18	5995	6012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314719
77	NC_019743	ATT	2	6	6109	6114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314719
78	NC_019743	TCC	2	6	6155	6160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314719
79	NC_019743	ACG	2	6	6252	6257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314719
80	NC_019743	ACT	2	6	6306	6311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314719
81	NC_019743	TCC	2	6	6362	6367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314719
82	NC_019743	C	7	7	6438	6444	0 %	0 %	0 %	100 %	428314719
83	NC_019743	GCC	2	6	6472	6477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314719
84	NC_019743	ATCA	2	8	6561	6568	50 %	25 %	0 %	25 %	428314719
85	NC_019743	GAA	2	6	6666	6671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314719
86	NC_019743	TCC	2	6	6713	6718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314719
87	NC_019743	AGA	2	6	6733	6738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314719
88	NC_019743	AAG	2	6	6741	6746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314719
89	NC_019743	TGT	2	6	6759	6764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314719
90	NC_019743	TAA	2	6	6767	6772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314719
91	NC_019743	TCC	2	6	6811	6816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314719
92	NC_019743	TCT	2	6	7017	7022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314719
93	NC_019743	A	6	6	7070	7075	100 %	0 %	0 %	0 %	428314719
94	NC_019743	ATT	2	6	7079	7084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314719
95	NC_019743	A	6	6	7090	7095	100 %	0 %	0 %	0 %	428314719
96	NC_019743	GC	3	6	7124	7129	0 %	0 %	50 %	50 %	428314719
97	NC_019743	AAG	2	6	7162	7167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314719
98	NC_019743	CAAC	2	8	7205	7212	50 %	0 %	0 %	50 %	428314719
99	NC_019743	GTT	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314719
100	NC_019743	TCC	2	6	7261	7266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314719
101	NC_019743	TTAA	2	8	7278	7285	50 %	50 %	0 %	0 %	428314719
102	NC_019743	CAT	2	6	7370	7375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314719
103	NC_019743	CAAC	2	8	7405	7412	50 %	0 %	0 %	50 %	428314719
104	NC_019743	AGA	2	6	7478	7483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314719
105	NC_019743	GAG	2	6	7499	7504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314719
106	NC_019743	CGA	2	6	7526	7531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314719
107	NC_019743	A	7	7	7622	7628	100 %	0 %	0 %	0 %	428314720
108	NC_019743	CAA	2	6	7661	7666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314720
109	NC_019743	GCAA	2	8	7734	7741	50 %	0 %	25 %	25 %	428314720
110	NC_019743	ACG	2	6	7793	7798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314720
111	NC_019743	GAA	2	6	7816	7821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314720
112	NC_019743	TTTGA	2	10	7909	7918	20 %	60 %	20 %	0 %	428314721
113	NC_019743	TGC	2	6	7938	7943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314721
114	NC_019743	A	7	7	7953	7959	100 %	0 %	0 %	0 %	428314721
115	NC_019743	TGA	2	6	7973	7978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314721
116	NC_019743	A	8	8	7987	7994	100 %	0 %	0 %	0 %	428314721
117	NC_019743	CTTTC	2	10	8087	8096	0 %	60 %	0 %	40 %	428314721
118	NC_019743	CT	3	6	8132	8137	0 %	50 %	0 %	50 %	428314721
119	NC_019743	CGGTG	2	10	8148	8157	0 %	20 %	60 %	20 %	428314721
120	NC_019743	GAT	2	6	8200	8205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314721
121	NC_019743	GGA	2	6	8260	8265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314721
122	NC_019743	GGC	3	9	8343	8351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314721
123	NC_019743	AGG	2	6	8381	8386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314721
124	NC_019743	GGC	2	6	8403	8408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314721
125	NC_019743	TCA	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314721
126	NC_019743	GAA	2	6	8451	8456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314721
127	NC_019743	A	6	6	8485	8490	100 %	0 %	0 %	0 %	428314721
128	NC_019743	TCC	2	6	8516	8521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314721
129	NC_019743	A	6	6	8525	8530	100 %	0 %	0 %	0 %	428314721
130	NC_019743	GGA	2	6	8535	8540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314721
131	NC_019743	AAG	2	6	8548	8553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314721
132	NC_019743	CCAA	2	8	8588	8595	50 %	0 %	0 %	50 %	428314721
133	NC_019743	GAG	2	6	8599	8604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314721
134	NC_019743	A	6	6	8612	8617	100 %	0 %	0 %	0 %	428314721
135	NC_019743	GAG	2	6	8647	8652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314721
136	NC_019743	AGA	2	6	8658	8663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314721
137	NC_019743	ACA	2	6	8693	8698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314721
138	NC_019743	GCT	2	6	8725	8730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314721
139	NC_019743	GAT	2	6	8736	8741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314721
140	NC_019743	TCG	2	6	8742	8747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314721
141	NC_019743	AGTA	2	8	8787	8794	50 %	25 %	25 %	0 %	428314721
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143	NC_019743	AATC	2	8	8869	8876	50 %	25 %	0 %	25 %	428314722
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154	NC_019743	AAAAG	2	10	9403	9412	80 %	0 %	20 %	0 %	428314722
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159	NC_019743	TTAA	2	8	9785	9792	50 %	50 %	0 %	0 %	428314722
160	NC_019743	TCC	2	6	9805	9810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314722
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250	NC_019743	GTG	2	6	14652	14657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314730
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256	NC_019743	GA	3	6	14981	14986	50 %	0 %	50 %	0 %	428314730
257	NC_019743	TGC	2	6	14989	14994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314730
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260	NC_019743	CCA	2	6	15186	15191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314730
261	NC_019743	GAT	2	6	15238	15243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314730
262	NC_019743	GATAGA	2	12	15409	15420	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428314730
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.